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Director del Instituto de Odontoestomatología · Universidad Austral de Chile

Dr. Diego Halabi

Cirujano Dentista, Doctor en Ciencias Médicas

Estudio cómo la disrupción circadiana y metabólica moldea la salud oral y sistémica, y desarrollo el software que hace reproducibles esta investigación y la docencia.

Próximamente: Director del Diplomado en Epidemiología Clínica (2027)

Dr. Diego Halabi

01Perfil

Soy un científico clínico que trabaja en la intersección de la cronobiología, la fisiología metabólica y la salud sistémica. Desde hace más de una década estudio cómo la disrupción circadiana durante el embarazo (cronodisrupción) programa enfermedades metabólicas y cardiovasculares en la descendencia, y cómo la melatonina materna puede prevenirlas en modelos animales. Este trabajo se ha publicado en revistas como The Journal of Physiology, Journal of Pineal Research y Frontiers in Endocrinology.

Adipocitos en fluorescencia

Formado como cirujano dentista y hoy director del Instituto de Odontoestomatología, conecto la salud oral y la sistémica a través del eje perio-sistémico: el vínculo biológico entre la enfermedad periodontal, la obesidad y la inflamación del tejido adiposo.

En paralelo, desarrollo y despliego el software que apoya este trabajo, desde herramientas de evaluación automatizada y plataformas de investigación reproducible hasta la infraestructura Linux que las sostiene, llevando rigor de ingeniería al trabajo académico y clínico.

02Investigación

Mi trabajo sigue tres líneas conectadas, desde el laboratorio hasta la clínica.

Ajuste de un modelo de cosinor en RStudio
Ajuste de un modelo de cosinor en R para cuantificar ritmos circadianos.

Métodos

  • Ensayos clínicos, estudios observacionales y revisiones sistemáticas (certificación Cochrane).
  • Regresión logística, modelos multivariados y de cosinor en R (tidyverse) y Python.
  • Reportes reproducibles y completamente programados con RMarkdown y LaTeX.
  • Cultivo celular y cirugía experimental en modelos de roedores.

03Software

Construyo las herramientas que necesitan mi docencia y mi investigación, y las publico cuando le sirven a otros.

EvaLumina para Mac mostrando la escala y la distribución de notas de una evaluación
EvaLumina para Mac: escala y distribución de notas.

EvaLumina

A la venta

Exámenes de selección múltiple en papel, de principio a fin: una forma distinta para cada estudiante, lectura óptica de las hojas escaneadas, escalas de notas configurables y análisis de ítems. Un motor en Rust con apps nativas para Mac, iPhone y Windows.

Rust SwiftUI WinUI 3 OMR
En uso

Asistente de IA para la enseñanza de la epidemiología

Plataforma de aprendizaje activo para la asignatura Odontología Preventiva y Epidemiología (ESOD 150). Calcula un perfil vocacional determinista y entrega retroalimentación generada por IA (Gemini, Claude) en tiempo real, como un estudio abierto y reproducible de investigación educativa con consentimiento informado.

FastAPI LLM Open Science
MVP

Plataforma de gestión de esterilización

Sistema web que reemplazó los vales en papel de la central de esterilización de la clínica odontológica UACh. Dirigí el proyecto y desarrollé el MVP, desplegado en un servidor Linux local (headless) para garantizar seguridad y disponibilidad institucional.

Linux Web app Self-hosted

Herramientas

Lenguajes y frameworks

R (tidyverse) Python Rust Swift / SwiftUI C# / WinUI 3 FastAPI SQL (PostgreSQL / SQLite)

Ingeniería aplicada

Visión por computador (OMR) Psicometría (análisis de ítems) Criptografía (Fernet, Ed25519) Integración de LLM (Gemini, Claude) SSE Streaming

Infraestructura

Linux Servidores headless CI/CD Vercel + Railway Publicación en App Store y Microsoft Store

04Docencia y gestión

Docencia y formación

Desde 2027 dirigiré el Diplomado en Epidemiología Clínica. Desarrollé una plataforma de aprendizaje asistida por IA para la asignatura Odontología Preventiva y Epidemiología, y dirigí el Programa Honor de Investigación en Medicina (2020–2023). En los últimos cinco años he guiado 12 tesis de odontología, tecnología médica, ciencias y administración de empresas, incluida una tesis de magíster en la Universidad de los Andes.

Gestión académica

Director del Instituto de Odontoestomatología, 2024–actualidad y 2019–2020. Comisión de autoevaluación para la acreditación CNA, 2021–actualidad. Consejo de Escuela de Odontología, 2021–2025.

Editorial y revisión de pares

Review Editor de Frontiers in Oral Health (2020–actualidad). Evaluador de proyectos y becas del panel de Ciencias Médicas de ANID (2018–actualidad). Revisor de BMC Oral Health, Frontiers in Endocrinology y BMJ Case Reports.

Premios

Premio Sleep Science a la mejor presentación, XV Simposio Latinoamericano de Cronobiología (Sociedad Brasileña de Sueño, 2019).

Conferencias invitadas destacadas

  • Desajuste de los ritmos circadianos: impacto en la salud nutricional y la obesidad

    XXIV Congreso de Nutrición SOCHINUT, Concepción, 2024

  • Estilo de vida saludable más allá de la dieta y el ejercicio: impacto de los ritmos circadianos

    XXXIV Congreso Chileno de Endocrinología y Diabetes (SOCHED), Viña del Mar, 2023

  • Link perio-sistémico: periodontitis y obesidad

    Simposio de Medicina Periodontal y Regenerativa, Sociedad de Periodoncia de Chile (SPCh), Santiago, 2023

  • Cronodisrupción y las consecuencias futuras en el feto

    Sociedad Chilena de Medicina del Sueño (SOCHIMES), Santiago, 2021

05Publicaciones

Sincronizado desde ORCID
24 resultados
2026 #1

Asociación entre obesidad abdominal con severidad en periodontitis en una población chilena. Estudio de corte transversal

Juárez-Membreño A, Céspedes-Barrientos MJ, Aros-Muñoz Y, Halabi D

Revista Odontológica Mexicana

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2026 #2

Prognostic Value of Neutrophil-to-Lymphocyte Ratio and Tumor-Infiltrating Lymphocytes (TILs), for Patients with Triple-Negative Breast Cancer

Soto M, Poblete MT, Ehrenfeld P, Halabi D

Cancer Investigation

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2024 #3

Sex-Specific Metabolic Effects of Gestational Chronodisruption and Maternal Melatonin Supplementation in Rat Offspring

Mendez N, Corvalan F, Halabi D, Vasquez A, Vergara K, Noriega H, Ehrenfeld P, Sanhueza K, Seron-Ferre M, Valenzuela GJ, Torres-Farfan C

Journal of Pineal Research

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2023 #4

Difference in Receptor Activator of Nuclear Factor k B Expression in Tumoral Tissue by Different Periodontal Pathogens

Maher A, Munoz DN, Pavicic MF, Gonzalez M, Ehrenfeld P, Halabi D, Munoz-Kramm A, Munoz H

International Journal of Morphology

2023 #5

From gestational chronodisruption to noncommunicable diseases: Pathophysiological mechanisms of programming of adult diseases, and the potential therapeutic role of melatonin

Mendez N, Corvalan F, Halabi D, Ehrenfeld P, Maldonado R, Vergara K, Seron-Ferre M, Torres-Farfan C

Journal of Pineal Research

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2022 #6

Effects of exercise on irisin in subjects with overweight or obesity. A systematic review of clinical studies

Bernal-Rivas C, Llamunao-Tropa A, Reyes-Barria A, Halabi D, Pavicic F, Ehrenfeld P, Martinez-Huenchullan S

Nutrición Hospitalaria

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2022 #7

Maternal melatonin treatment rescues endocrine, inflammatory, and transcriptional deregulation in the adult rat female offspring from gestational chronodisruption

Mendez N, Halabi D, Salazar-Petres ER, Vergara K, Corvalan F, Richter HG, Bastidas C, Bascur P, Ehrenfeld P, Seron-Ferre M, Torres-Farfan C

Frontiers in Neuroscience

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2022 #8

New integrative approaches to discovery of pathophysiological mechanisms triggered by night shift work

Richter HG, Mendez N, Halabi D, Torres-Farfan C, Spichiger C

Chronobiology International

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2021 #9

Maternal Chronodisruption Throughout Pregnancy Impairs Glucose Homeostasis and Adipose Tissue Physiology in the Male Rat Offspring

Halabi D, Richter HG, Mendez N, Kahne T, Spichiger C, Salazar E, Torres F, Vergara K, Seron-Ferre M, Torres-Farfan C

Frontiers in Endocrinology

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2020 #10

Fetal programming of adipose tissue function by gestational chronodisruption

Halabi D, Ehrenfeld P, Mendez N, Richter HG, Torres-Farfan C

Sleep Science

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2019 #11

Fetal Programming of Renal Dysfunction and High Blood Pressure by Chronodisruption

Mendez N, Torres-Farfan C, Salazar E, Bascur P, Bastidas C, Vergara K, Spichiger C, Halabi D, Vio CP, Richter HG

Frontiers in Endocrinology

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2019 #12

Pericytes Favor Oligodendrocyte Fate Choice in Adult Neural Stem Cells

Silva ME, Lange S, Hinrichsen B, Philp AR, Reyes CR, Halabi D, Mansilla JB, Rotheneichner P, de la Fuente AG, Couillard-Despres S, Batiz LF, Franklin RJM, Aigner L, Rivera FJ

Frontiers in Cellular Neuroscience

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2019 #13

Soluble factors derived from brain pericytes promote neural stem cells to generate oligodendrocytes

Rivera FJ, Silva ME, Lange S, Hinrichsen B, Philp AR, Reyes CR, Halabi D, Mansilla J, Rotheneichner P, de la Fuente AG, Couillard-Despres S, Batiz LF, Franklin RJ, Aigner L

Glia

2018 #14

Calidad metodológica de estudios clínicos de ortodoncia publicados entre 2012-2016

Ruiz Chaura C, Ulloa Riffo N, Halabi D, Muñoz Martínez HD

Odontoestomatología

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2018 #15

Chlorhexidine for prevention of alveolar osteitis: a randomised clinical trial

Halabi D, Escobar J, Alvarado C, Martinez N, Munoz C

Journal of Applied Oral Science

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2018 #16

Design and Validation of a Basic Dental Psychomotor Skills Test for Novice Dental Students

Segura C, Halabi D, Navarro N

Journal of Dental Education

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2018 #17

Gestational chronodisruption leads to persistent changes in the rat fetal and adult adrenal clock and function

Salazar ER, Richter HG, Spichiger C, Mendez N, Halabi D, Vergara K, Alonso IP, Corvalan FA, Azpeleta C, Seron-Ferre M, Torres-Farfan C

The Journal of Physiology

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2017 #18

GESTATIONAL CHRONODISRUPTION IMPAIRS CIRCADIAN PHYSIOLOGY IN RAT MALE OFFSPRING, INCREASING THE RISK OF CHRONIC DISEASE

Torres-Farfan C, Mendez N, Halabi D, Spichiger C, Salazar ER, Vergara K, Richter HG

Placenta

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2016 #19

Chlorhexidine mouthwash for the prevention of alveolar osteitis after oral surgery

Halabi D

Registro ISRCTN (registro de ensayo)

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2016 #20

Gestational Chronodisruption Impairs Circadian Physiology in Rat Male Offspring, Increasing the Risk of Chronic Disease

Mendez N, Halabi D, Spichiger C, Salazar ER, Vergara K, Alonso-Vasquez P, Carmona P, Sarmiento JM, Richter HG, Seron-Ferre M, Torres-Farfan C

Endocrinology

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2015 #21

Comparison of marginal adaptation between a monoincremental resin with sonic activation and a conventional resin

Villa J, Meier R, Ruiz P, Halabi D

Journal of Oral Research

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2015 #22

Prevalence of neuropathic symptoms in patients referred for temporomandibular disorder in a Chilean hospital, 2014-2015

Miranda S, Gayoso C, Ruiz P, Halabi D

Journal of Oral Research

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2014 #23

Association between abdominal obesity and periodontal disease. Cross-sectional study

Juarez I, Hernández M, Letelier C, Halabi D, Araneda C

Journal of Oral Research

Ver artículo
2012 #24

Logistic Regression Analysis of Risk Factors for the Development of Alveolar Osteitis

Halabi D, Escobar J, Muñoz C, Uribe S

Journal of Oral and Maxillofacial Surgery

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06Financiamiento

Sincronizado desde ORCID
Roles según mi CV
2022 - 2023 VIDCA-INID210009-03

Melatonina en bayas chilenas: un regalo cronobiótico de la naturaleza

Investigador Asociado

Universidad Austral de Chile (VIDCA)

2019 - 2022 FONDECYT 11190711

A white and brown balance of obesity; developmental programming of adipose tissue by chronodisruption

Investigador Principal

ANID (ex CONICYT)

2018 - 2020 FONDEF ID17AM0043

La fuente de la juventud: desarrollo de un suplemento antioxidante, antiinflamatorio y neuroregenerativo derivado del lúpulo para el rejuvenecimiento cerebral

Investigador Postdoctoral

ANID (ex CONICYT)